The X-Files

Tad O'Malley, en populær programleder, har tatt kontakt med Mulder og Scully da han tror han har avdekket en stor konspirasjon. Gjennom ham treffer de Sveta, som muligens har vært bortført av romvesener.

Når en forsker plutselig tar selvmord undersøker Mulder og Scully hvilke krefter som kan ha drevet ham til det. De oppdager et laboratorium der genetiske eksperimenter har foregått i årtier.

Når et lik blir funnet i skogen blir Mulder og Scully satt til å undersøke om drapet ble utført av et dyr, en seriemorder eller kanskje bare et underlig vesen, slik øyevitnebeskrivelsene forteller.

Mulder og Scully skal undersøke mordet på en offentlig ansatt - som ikke virker begått av mennesker. Scully må håndtere en personlig tragedie som bringer frem vonde følelser.

Når et galleri som viser potensielt fornærmende kunst blir bombet, forsøker Mulder og Scully å finne en måte å kommunisere med terroristen, som ligger i koma, for slik å forhindre flere angrep.

Alvorlig sykdom sprer seg over hele landet, noe som fører til utbredt panikk i befolkningen. Scully forsøker å finne en kur, mens Mulder konfronterer den han tror står bak.